De acordo com a Empire Magazine, Planeta dos Macacos: O Reinado se passará cerca de 300 anos depois que César trouxe seu clã de macacos para a terra prometida. A história seguirá o legado de César ao explorar o reinado de um novo líder, um jovem macaco chamado Noa. Com apenas resquícios do legado de César ainda intactos, já que sua morte terá ocorrido há mais de três séculos, será interessante ver como o filme consegue fazer referência a César.
Ao longo do desenvolvimento de Planeta dos Macacos: O Reinado, houve vários relatos sobre quem seriam os personagens principais da história. A princípio, pensava-se que as pistas seriam encontradas em Cornélio e Nova, o filho mais novo de César e a garota humana de Planeta dos Macacos: A Guerra, respectivamente. Esta teoria foi posteriormente refutada, e as notícias mais recentes cimentam ainda mais que este filme existe em um cenário muito diferente.