Parece que Homem-Aranha: Através do Aranhaverso é uma experiência mais imersiva do que se pensava originalmente, pois foi confirmado que têm diferentes versões do filme nos cinemas, e o público está começando a perceber. Em suas redes sociais, o editor Andrew Leviton parabenizou um espectador por identificar os diferentes cortes. Embora as diferenças não estejam nos principais pontos da trama, certamente é fascinante observar os detalhes que podem não parecer os mesmos após rever o filme.
Um dos elementos que acabam sendo diferentes em Homem-Aranha: Através do Aranhaverso é a parte onde Miguel O'Hara (Oscar Isaac) manda sua assistente digital, Lyla (Greta Lee), chamar reforços. Em uma versão do filme, a interface simplesmente aponta para o herói futurista, enquanto na outra, ela tira uma selfie com ele. Outro exemplo de diferença é o diálogo que The Spot (Jason Schwartzman) tem enquanto fala consigo mesmo quando está construindo sua própria máquina de teletransporte.